Optimus Prime (con la voz de Peter Cullen), Bumblebee y el resto de los Autobots se enfrentan a Megatron (con la voz de Frank Welker) y a los Decepticons malvados. Mientras ellos están luchando contra el mal y tratando de proteger la Tierra de ser destruida, los Autobots además tienen que proteger a Jack, Miko y Raf, los tres jóvenes que accidentalmente los descubrieron.