En una de sus batallas épicas, el Equipo de Mazinger sufre una aplastante derrota a manos del Dr. Infierno y sus secuaces, tras ser robado Mazinger Z, y su piloto, el legendario Kôji Kabuto, desaparecido en acción. Justo cuando el segundo al mando del Dr. Infierno, el Barón Ashura, utiliza a Mazinger Z contra nuestros héroes, Kôji hace un regreso sorpresivo en Mazinkaiser, un Mazinger totalmente nuevo con una armadura más pesada y ataques letales.