Sexta saga a modo de spinoff de la serie Digimon. Un día, un Digimon Xros Loader aparece frente a Taiki, un chico de séptimo escepcionalmente amable, junto a la voz de Shoutmon pidiendo su ayuda. El Digimon Xros Loader es un objeto que es capaz de transferir energía a un Digimon, a esta acción se la conoce como DigiXros. Taiki ha sido elegido como “General” para controlarlo, de modo que él y sus amigos son enviados a un universo paralelo, el Mundo Digital. A causa de la aparición de Digimon rivales y enemigos, el Mundo Digital está sumergido de lleno en una Xros War, como si se tratase de una guerra a gran escala de la era Sengoku. Taiki y Shoutmon crean una Armada Digimon utilizando el Digimon Xros Loader para luchar en la guerra.